咖啡豆和一般農作物一樣，會因種植地的土地、氣候、日照時間、海拔高度、排水品質、後製處理、倉儲方式等的不同，咖啡的風味也會有所不同。
而通常會因生長、後製處理和倉儲以及運送的過程中產生壞豆。
壞豆的種類有：黑豆、蟲蛀豆、帶殼豆、破碎豆、死豆、1/3豆、未熟豆、乾豆、發霉豆、發酵豆、枯萎豆、貝殼豆及外來物。
外觀：整顆黑黑的
原因：微生物所引起的色素過度發酵
影響：會有發酵味、發臭味、腐酸味
外觀：咖啡豆表面會有洞，有時在咖啡豆的頭尾較不易發現
原因：咖啡果甲蟲鑽進咖啡豆內產卵，屬於咖啡農業中最嚴重的蟲害
影響：會帶有發臭味、酸腐味或是發霉味
外觀：咖啡豆外有一層薄薄的殼包覆住
原因；去皮時沒去乾淨
影響：會影烘焙均勻度
外觀：咖啡豆有缺角
原因：在去除果肉或乾燥製程中，機器設備不良造成對咖廢豆的過度壓迫或磨擦
影響：會有發酵味和發臭味
外觀：相較於其他咖啡豆，它會看起來特別白
外觀：外表有點蒼白，形狀呈內凹曲線
原因：不適當的收成未成熟果實
影響：會帶有草味、稻草味，也是澀感來源
外觀：乾掉的果肉覆蓋在帶殼豆上
原因：乾旱或病害造成咖啡果實在樹上乾掉而落地，或是在水洗或日曬的後至處理不佳
影響：帶有霉味、發酵味
外觀：咖啡豆表面會有一點一點的小黑點
原因：在收成到儲藏的過程中，只要溫度和濕度適合，黴菌就會產生
影響：帶有霉味、發酵味和土味
外觀：會有石頭或是樹枝
原因：會在收成或是後至時參入
影響：會因外來物的不同味道而帶來不好的風味，也會對研磨設備成損壞
外觀：外表顏色可能會有黃色、黃棕色、紅棕色
原因：在收成或後製過程中由細菌汙染造成的發酵，像是收成過熟豆或後製的水汙染
影響：在烘焙時會汙染整鍋的豆子，會帶有發酵味、酸味
外觀：很像手在水裡泡太久，手會皺皺的樣子
原因：在果實的生長過程中缺少水分
影響：會帶有菸草味、草味
外觀：外部成貝殼狀，內部成圓錐狀或圓筒狀，有時會結合在一起，誤以為是圓豆
原因：屬於遺傳學的自然現象
影響：會帶有焦味、在大量烘豆會造成烘焙不均
有時挑豆的樂趣是可以收集到各個國家的石頭，也可替自己的健康把關一下。
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